PorB variable loop sequences

These legacy sequences are no longer being updated. They are listed here as they may be referred to in publications.

Variable loops Peptide sequence Class
I.1 VEVSRVKDAGTYKAQGGKSKTATQI 2
I.2 VEVSRVKNQGVKTKTATQI 2
I.3 VETSRSVAHNGAQAASVETGTGI 3
I.4 VETSRSVEHNGGQVVSVETGTGI 3
I.5 VETSRSVEHKGGQVVSVETGTGI 3
I.6 VETSRSLDYQDGQVYSVETGTGI 3
I.7 VETSRSVFHQNGQVTEVTTATGI 3
I.8 VETSRSVFHQNGQVTEVATATGI 3
I.9 VETSRSVYYEDGKAAEVTTGTGI 3
I.10 VETSRSVAHNGAQAATVETGTGI 3
I.11 VETSRSLNYQDGQVYSVETGTGI 3
I.12 VETSRSVFHQNGQVTEVTTGTGI 3
I.13 VETSRSVEHNRGQVVSVETGTGI 3
I.14 EVSRVKDKGGNSKTATQI 2
I.15 EVSRVKDAGTYKAQGGKSKTATQI 2
I.16 VETSRSVKHNGGQVVSVETGTGI 3
I.17 VETSRSVYYEDGKAAEVTTDTGI 3
I.18 EVSRVKNQGVKTKTATQI 2
I.19 EVSRVKDADTYKAQGGKSKTATQI 2
I.20 EVSRVKTKTATQI 2
I.21 VETSRSVYYKDGKAAEVTTGTGI 3
I.22 EVSRVKNQGVKNQGVKNQGVKNQGVKNQGVKNQGVKTKTATQI 2
I.23 EVSRVKDANAYKAQGGKSKTATQI 2
I.24 LNDNAGRHNS 3
I.25 VETSRSVTHNGAQAASVETGTGI 3
I.26 VETSRSVYYEDGKAAKVTTGTGI 3
IV.1 PRDNANDVDKYKHTKSSR 2
IV.2 PRDNANDVDKYKHMKSSR 2
IV.3 PRDNANDKDKYTHKQSSR 2
IV.4 PRDNANDKDKYEHHKSSR 2
IV.5 LNDNAGKYNS 3
IV.6 LNDNVGRHNS 3
IV.7 LNDNAGRHNS 3
IV.8 PRDNANDVDKYKHMKPSR 2
IV.9 PRDNANDLDKYTHKQSSR 2
IV.10 PRDNANDADRYKHTKSSR 2
IV.11 PRDNANDKDKYTHHDSSR 2
IV.12 LNDNAGKHNS 3
IV.13 PRDNANDKDKYTHMKSSR 2
IV.15 PRDNANDKDKYQHTKSSR 2
V.1 KYADLNTDAERVAVNTANAHPVKDY 2
V.2 KYADLKDNAERVAVNTANAHPVKDY 2
V.3 KYADLNKDAERVAAGTSGAYAVKDY 2
V.4 KYADLNNDAERVAVNTPNAHAVKDY 2
V.5 KYADLNTDAERVAVGATDANPVKDY 2
V.6 RHHQVQENVNIEKY 3
V.7 RHVRVDENVNIEKY 3
V.8 RHHQVQEDLNIEKY 3
V.9 RHHRVQEDINIEKY 3
V.10 RHHQVQEGLNIEKY 3
V.11 RHQDVDDVKIEKY 3
V.12 RHQNVDNVKIEKY 3
V.13 RHEQIDNVKIEKY 3
V.14 RHQNVDVKIEKY 3
V.15 RHERVDKNVNIEKY 3
V.16 RHHQVVQEDLNIEKY 3
V.17 RHQDVDGVKIEKY 3
V.18 KYADSDAYAKPVAVGTANALPVKDY 2
V.19 KYADLKDNAERVAVNTAGAHAVKDY 2
V.20 RHQDVDNVKIEKY 3
V.21 KYADSDAYAKRVAPGTGLAVKDY 2
V.22 RHEQIGNVKIEKY 3
V.23 KYADLKDNAERVAVGTTGAHPVKDY 2
V.24 RHEKIDNVKIEKY 3
V.25 KYADLNTDAERVAERVAVNTANAHPVKDY 2
V.26 RHQDVGNVKIEKY 3
V.27 KYADLNDDAERVAVGTANSNPVKDY 2
V.28 KYADLNTDGKRVAVDNTDANAVKDY 2
V.29 KYADLNNDAERVAAGTSGAHAVKDYQ 2
V.30 KYADLNTDAERVAVGTTGAHPVKDY 2
V.31 RHQDVNDVKIEKY 3
V.32 RHQDVDDKY 3
VI.1 AAKNNEVGSTKGKKHEQTQ 2
VI.2 AAKNNTGTVGKQGKKHEQTQ 2
VI.3 AAKQGKKHEQTQ 2
VI.4 AAKNNEVGNLNIGKKHEQTQ 2
VI.5 AAKNNTVSVGEQGKKHEQTQ 2
VI.6 DAKLALPNDNSHNSQTE 3
VI.7 DAKLVEENYSHNSQTE 3
VI.8 DAKLTEENYSHNSQTE 3
VI.9 DAKLVEDNYSHNSQTE 3
VI.10 DAKLVEDNSHNSQTE 3
VI.11 DAKLVKDNSHNSQTE 3
VI.12 DAKLTDASNSHNSQTE 3
VI.13 DAKLALPNNNSHNSQTE 3
VI.14 AAKNNTGSVGEQGKKHEQTQ 2
VI.15 DAKLVADNSHNSQTE 3
VI.16 AAKNNKVGSTDVGKKYDQTQ 2
VI.17 AAKNNEVGSTDVGKKHEQTQ 2
VI.18 AAKNNDANPATNGKKLEQTQ 2
VI.19 AAKNNKVGSTKGKKHEQTQ 2
VI.20 AAKNNDTSPATNKKHEQTQ 2
VI.21 AAKNNDTNPATNGKKLEQTQ 2
VI.22 DAKLVADNYSHNSQTE 3
VI.23 DAKLVEKNYSHNSQTE 3
VI.24 DAKLVKDNYSHNSQTE 3
VI.25 DAKLVEGNSHNSQTE 3
VI.26 AKNNEVGSTAIGKKHEQTQ 2
VI.27 AAKNNDTKPATNGKKLEQTQ 2
VI.28 AAKNNDGSANNGKKHEQTQ 2
VI.29 AAKNNTGTAEQGKKHEQTQ 2
VI.30 AAKNNDSDIGKKDEQTQ 2
VI.31 DAKLVEDNYSHNSTTE 3
VI.32 DEKLVKDNSHNSQTE 3
VII.1 KVNGVKDANYQYDQ 2
VII.2 KVNGEKVARYQYDQ 2
VII.3 KVNGEKAARYQYDQ 2
VII.4 KVNGKKAARYQYDQ 2
VII.5 SFDDADLSNDYDQ 3
VII.6 SFDATNYNNDYDQ 3
VII.7 SVDDAKRDNTYDQ 3
VII.8 LVDSADYTNDYDQ 3
VII.9 SFDDADYTNDYDQ 3
VII.10 LVDNADIGNEYDQ 3
VII.11 LVDDADIGNEYDQ 3
VII.12 SFDDADRYNTYDQ 3
VII.13 LVDSADLSNDYDQ 3
VII.14 SFDNADIGNEYDQ 3
VII.15 SFDGADLSNDYDQ 3
VII.16 KVNGEKVASYQYDQ 2
VII.17 KIKGKKDADTQYDQ 2
VII.18 KINGKKDADTRYDQ 2
VII.19 KVNGVKKASYQYDQ 2
VII.20 SFDDAALSNDYDQ 3
VII.21 KENGVKDANQYDQ 2
VII.22 SFDDADYPNDYDQ 3
VII.23 LFDDADRYNTYDQ 3
VII.24 SFDAADYNNDYDQ 3
VII.25 LVNDADIGNEYDQ 3
VII.26 LVDDANIGNEYDQ 3
VII.27 VNGVKDANYQYDQ 2
VII.28 LVDDADVGNEYDQ 3
VII.29 FDDDADYTNDYDQ 3
VII.30 KVNGMKAKVNGMKDANYQYDQ 2
VII.31 KVNGVKEARYQYDQ 2
VII.32 LFDDADLSNDYDQ 3
VII.33 SFDDAADYTNDYDQ 3
VII.34 SFNDADLSNDYDQ 3
VII.35 LVDDADMGNEYDQ 3
VII.36 SFDDANLSNDYDQ 3
VIII.1 KQGKGAGKVEQT 2
VIII.2 KEGKGVNKTEKT 2
VIII.3 QEGKGKNKTEKT 2
VIII.4 QEGKGKNKFVST 3
VIII.5 QEGKGENKFVST 3
VIII.6 QEGKGENKFVAT 3
VIII.7 QEGEGESKFVST 3
VIII.8 QEGKGESKFVST 3
VIII.9 QESKGENKFVST 3
VIII.10 QEGKSENKFVAT 3
VIII.11 KQGKGARKVEQT 2
VIII.12 QDGKGENKFVAT 3
VIII.13 KEGKGDTKKTST 2
VIII.14 KQGKGAGRKVEQT 2
VIII.15 QKGKGENKFVST 3
VIII.16 KEDKGVNKTEKT 2
VIII.17 QESKGESKFVST 3
VIII.18 QGGKGESKFVST 3